Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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126 Hemimorphite (H2Zn2SiO5)

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                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     5.12  10.73   8.37  90.00  90.00  90.00    459.2   3.484
                                       PM6:     5.40  10.61   8.32  90.11  89.94  90.01    476.5   3.358
                 X-Ray                               PM6
 
  X-Ray data set:
 1SCF MERS=(2,1,1)
     Hemimorphite

 Si              0.00000000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
 Si              0.00000000 +1    3.1440000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              1.34000000 +1    3.7769990 +1    0.6580000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1    3.3630000 +1   -1.6050000 +1                  0.0000
  O              2.55200000 +1    1.5720000 +1   -2.3860000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1    1.5720000 +1    0.4280000 +1                  0.0000
  H              3.12900000 +1    1.5720000 +1   -1.6220000 +1                  0.0000
 Zn              1.71300000 +1    3.3029990 +1    2.5190000 +1                  0.0000
 Zn              2.47100000 +1    5.2060000 +1   -0.0390000 +1                  0.0000
  O             -5.52400000 +1   -5.9980000 +1    3.2160000 +1                  0.0000
 Zn              1.71300000 +1   -0.1590000 +1    2.5190000 +1                  0.0000
  O             -1.34000000 +1    3.7769990 +1    0.6580000 +1                  0.0000
 Zn             -1.71300000 +1    3.3029990 +1    2.5190000 +1                  0.0000
 Zn             -2.47100000 +1   -2.0620000 +1   -0.0380000 +1                  0.0000
 Si             -4.18300000 +1   -2.2210010 +1    2.5580000 +1                  0.0000
  O             -2.84300000 +1   -1.5880000 +1    3.2160000 +1                  0.0000
  O             -4.18300000 +1   -2.0020000 +1    0.9530000 +1                  0.0000
  O             -1.63200000 +1   -3.7930010 +1    0.1710000 +1                  0.0000
  O             -4.18300000 +1   -3.7930010 +1    2.9850000 +1                  0.0000
  H             -1.05400000 +1   -3.7930010 +1    0.9350000 +1                  0.0000
 Si             -4.18300000 +1   -5.3650010 +1    2.5580000 +1                  0.0000
 Zn             -1.71300000 +1   -0.1590010 +1    2.5190000 +1                  0.0000
  O             -1.34000000 +1   -0.6330010 +1    0.6580000 +1                  0.0000
 Zn             -2.47100000 +1    5.2060000 +1   -0.0380000 +1                  0.0000
  O             -5.52400000 +1   -1.5880000 +1    3.2160000 +1                  0.0000
 Zn              2.47100000 +1   -2.0620000 +1   -0.0380000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1   -0.2190000 +1   -1.6050000 +1                  0.0000
  O             -2.55200000 +1    1.5719990 +1   -2.3860000 +1                  0.0000
  H             -3.12900000 +1    1.5719990 +1   -1.6220000 +1                  0.0000
  O              1.34000000 +1   -0.6330010 +1    0.6580000 +1                  0.0000
  O             -4.18300000 +1   -5.5840010 +1    0.9530000 +1                  0.0000
  O              1.63200000 +1   -3.7930010 +1    0.1710000 +1                  0.0000
  H              1.05400000 +1   -3.7930010 +1    0.9350000 +1                  0.0000
  O             -2.84300000 +1   -5.9980000 +1    3.2160000 +1                  0.0000
  O             -4.18300000 +1    1.5720000 +1    0.0610000 +1                  0.0000
  H             -4.80600000 +1    1.5720000 +1    0.6940000 +1                  0.0000
  H             -3.56100000 +1    1.5720000 +1    0.6940000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1   -3.7930010 +1   -2.4960000 +1                  0.0000
  H             -0.62300000 +1   -3.7930010 +1   -1.8640000 +1                  0.0000
  H              0.62300000 +1   -3.7930010 +1   -1.8640000 +1                  0.0000
 Si              0.00000000 +1    0.0000000 +1    5.1150000 +1                  0.0000
 Si              0.00000000 +1    3.1440000 +1    5.1150000 +1                  0.0000
  O              1.34000000 +1    3.7769990 +1    5.7730000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1    3.3630000 +1    3.5100000 +1                  0.0000
  O              2.55200000 +1    1.5720000 +1    2.7290000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1    1.5720000 +1    5.5430000 +1                  0.0000
  H              3.12900000 +1    1.5720000 +1    3.4930000 +1                  0.0000
 Zn              1.71300000 +1    3.3029990 +1    7.6340000 +1                  0.0000
 Zn              2.47100000 +1    5.2060000 +1    5.0760000 +1                  0.0000
  O             -5.52400000 +1   -5.9980000 +1    8.3310000 +1                  0.0000
 Zn              1.71300000 +1   -0.1590000 +1    7.6340000 +1                  0.0000
  O             -1.34000000 +1    3.7769990 +1    5.7730000 +1                  0.0000
 Zn             -1.71300000 +1    3.3029990 +1    7.6340000 +1                  0.0000
 Zn             -2.47100000 +1   -2.0620000 +1    5.0770000 +1                  0.0000
 Si             -4.18300000 +1   -2.2210010 +1    7.6730000 +1                  0.0000
  O             -2.84300000 +1   -1.5880000 +1    8.3310000 +1                  0.0000
  O             -4.18300000 +1   -2.0020000 +1    6.0680000 +1                  0.0000
  O             -1.63200000 +1   -3.7930010 +1    5.2860000 +1                  0.0000
  O             -4.18300000 +1   -3.7930010 +1    8.1000000 +1                  0.0000
  H             -1.05400000 +1   -3.7930010 +1    6.0500000 +1                  0.0000
 Si             -4.18300000 +1   -5.3650010 +1    7.6730000 +1                  0.0000
 Zn             -1.71300000 +1   -0.1590010 +1    7.6340000 +1                  0.0000
  O             -1.34000000 +1   -0.6330010 +1    5.7730000 +1                  0.0000
 Zn             -2.47100000 +1    5.2060000 +1    5.0770000 +1                  0.0000
  O             -5.52400000 +1   -1.5880000 +1    8.3310000 +1                  0.0000
 Zn              2.47100000 +1   -2.0620000 +1    5.0770000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1   -0.2190000 +1    3.5100000 +1                  0.0000
  O             -2.55200000 +1    1.5719990 +1    2.7290000 +1                  0.0000
  H             -3.12900000 +1    1.5719990 +1    3.4930000 +1                  0.0000
  O              1.34000000 +1   -0.6330010 +1    5.7730000 +1                  0.0000
  O             -4.18300000 +1   -5.5840010 +1    6.0680000 +1                  0.0000
  O              1.63200000 +1   -3.7930010 +1    5.2860000 +1                  0.0000
  H              1.05400000 +1   -3.7930010 +1    6.0500000 +1                  0.0000
  O             -2.84300000 +1   -5.9980000 +1    8.3310000 +1                  0.0000
  O             -4.18300000 +1    1.5720000 +1    5.1760000 +1                  0.0000
  H             -4.80600000 +1    1.5720000 +1    5.8090000 +1                  0.0000
  H             -3.56100000 +1    1.5720000 +1    5.8090000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1   -3.7930010 +1    2.6190000 +1                  0.0000
  H             -0.62300000 +1   -3.7930010 +1    3.2510000 +1                  0.0000
  H              0.62300000 +1   -3.7930010 +1    3.2510000 +1                  0.0000
 Tv              0.00000000 +1    0.0000000 +1   10.2300000 +1 
 Tv              0.00000000 +1  -10.7300000 +1    0.0000000 +1 
 Tv              8.36700000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1 
 
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(2,1,1) GNORM=5
     Hemimorphite

 Si        -0.00821590 +1   -0.0331199 +1   -0.1168442 +1                      0.0000
 Si         0.02561930 +1    3.1234690 +1   -0.1043530 +1                      0.0000
  O         1.21460666 +1    3.9462124 +1    0.6738661 +1                      0.0000
  O         0.04248187 +1    3.2758181 +1   -1.7346126 +1                      0.0000
  O         2.78425960 +1    1.5294091 +1   -3.2347612 +1                      0.0000
  O         0.25346482 +1    1.5414744 +1    0.2328499 +1                      0.0000
  H         3.59396600 +1    1.5189371 +1   -2.6064928 +1                      0.0000
 Zn         1.68818142 +1    3.2158868 +1    2.5308315 +1                      0.0000
 Zn         2.58227566 +1    5.1305857 +1   -0.1525365 +1                      0.0000
  O        -5.41079861 +1   -6.1209895 +1    3.3242807 +1                      0.0000
 Zn         1.65257229 +1   -0.1784804 +1    2.5203167 +1                      0.0000
  O        -1.44307229 +1    3.5250328 +1    0.5473263 +1                      0.0000
 Zn        -1.67080358 +1    3.2112887 +1    2.5580473 +1                      0.0000
 Zn        -2.46043478 +1   -2.0686186 +1   -0.1636511 +1                      0.0000
 Si        -4.15603957 +1   -2.1467362 +1    2.5644004 +1                      0.0000
  O        -2.68124533 +1   -1.7785184 +1    3.2231917 +1                      0.0000
  O        -4.16364075 +1   -1.9926529 +1    0.9339172 +1                      0.0000
  O        -1.35593427 +1   -3.7532842 +1    0.2349172 +1                      0.0000
  O        -4.42658099 +1   -3.7227532 +1    2.9007465 +1                      0.0000
  H        -1.08988701 +1   -3.7601498 +1    1.2145303 +1                      0.0000
 Si        -4.20988069 +1   -5.3050971 +1    2.5565485 +1                      0.0000
 Zn        -1.70464053 +1   -0.1137804 +1    2.5445973 +1                      0.0000
  O        -1.48347538 +1   -0.4136502 +1    0.5322257 +1                      0.0000
 Zn        -2.37941654 +1    5.2100318 +1   -0.1361410 +1                      0.0000
  O        -5.32948755 +1   -1.2976276 +1    3.3378179 +1                      0.0000
 Zn         2.50470443 +1   -2.0902731 +1   -0.1819873 +1                      0.0000
  O         0.00487663 +1   -0.1724230 +1   -1.7485455 +1                      0.0000
  O        -2.81785811 +1    1.5789769 +1   -2.4438672 +1                      0.0000
  H        -3.08359682 +1    1.5781860 +1   -1.4644479 +1                      0.0000
  O         1.16819600 +1   -0.8784628 +1    0.6553765 +1                      0.0000
  O        -4.22158688 +1   -5.4507426 +1    0.9249989 +1                      0.0000
  O         1.37317682 +1   -3.7654277 +1   -0.5522911 +1                      0.0000
  H         0.55751119 +1   -3.7519241 +1    0.0655603 +1                      0.0000
  O        -2.74725267 +1   -5.7189640 +1    3.2139903 +1                      0.0000
  O        -4.39920417 +1    1.5659036 +1   -0.0498796 +1                      0.0000
  H        -5.35578632 +1    1.5938657 +1    0.1216942 +1                      0.0000
  H        -3.97834229 +1    1.5636641 +1    0.8285652 +1                      0.0000
  O         0.19441344 +1   -3.7323748 +1   -2.7220534 +1                      0.0000
  H        -0.23977505 +1   -3.7495878 +1   -1.8498670 +1                      0.0000
  H         1.14966080 +1   -3.7512500 +1   -2.5377234 +1                      0.0000
 Si        -0.01653459 +1   -0.0491601 +1    5.2803629 +1                      0.0000
 Si         0.01846505 +1    3.1079452 +1    5.2916402 +1                      0.0000
  O         1.20909007 +1    3.9284403 +1    6.0698200 +1                      0.0000
  O         0.03282930 +1    3.2596175 +1    3.6611711 +1                      0.0000
  O         2.76873410 +1    1.5086140 +1    2.1616198 +1                      0.0000
  O         0.24800121 +1    1.5257950 +1    5.6280553 +1                      0.0000
  H         3.58158247 +1    1.4965092 +1    2.7830385 +1                      0.0000
 Zn         1.68067297 +1    3.1982897 +1    7.9272548 +1                      0.0000
 Zn         2.57264135 +1    5.1180038 +1    5.2424954 +1                      0.0000
  O        -5.41831532 +1   -6.1389222 +1    8.7191739 +1                      0.0000
 Zn         1.64747984 +1   -0.1902314 +1    7.9163476 +1                      0.0000
  O        -1.44927736 +1    3.5105610 +1    5.9445564 +1                      0.0000
 Zn        -1.67796730 +1    3.1956084 +1    7.9547521 +1                      0.0000
 Zn        -2.46771763 +1   -2.0853355 +1    5.2348931 +1                      0.0000
 Si        -4.16636643 +1   -2.1634623 +1    7.9602209 +1                      0.0000
  O        -2.69147409 +1   -1.7944634 +1    8.6178063 +1                      0.0000
  O        -4.17316804 +1   -2.0117706 +1    6.3296840 +1                      0.0000
  O        -1.36198708 +1   -3.7675007 +1    5.6420631 +1                      0.0000
  O        -4.43599062 +1   -3.7389448 +1    8.2991920 +1                      0.0000
  H        -1.10511944 +1   -3.7742417 +1    6.6249778 +1                      0.0000
 Si        -4.21941343 +1   -5.3202004 +1    7.9518431 +1                      0.0000
 Zn        -1.71407085 +1   -0.1297939 +1    7.9426970 +1                      0.0000
  O        -1.49208104 +1   -0.4278168 +1    5.9298921 +1                      0.0000
 Zn        -2.38518635 +1    5.1971132 +1    5.2620799 +1                      0.0000
  O        -5.33757289 +1   -1.3132602 +1    8.7348380 +1                      0.0000
 Zn         2.49464865 +1   -2.1079710 +1    5.2144504 +1                      0.0000
  O        -0.00501728 +1   -0.1918735 +1    3.6489912 +1                      0.0000
  O        -2.82327293 +1    1.5591153 +1    2.9544294 +1                      0.0000
  H        -3.08605800 +1    1.5571487 +1    3.9349746 +1                      0.0000
  O         1.16047308 +1   -0.8933869 +1    6.0529447 +1                      0.0000
  O        -4.23004105 +1   -5.4633184 +1    6.3201426 +1                      0.0000
  O         1.35890910 +1   -3.7807214 +1    4.8387705 +1                      0.0000
  H         0.54370125 +1   -3.7678617 +1    5.4587050 +1                      0.0000
  O        -2.75782228 +1   -5.7362394 +1    8.6086849 +1                      0.0000
  O        -4.40860190 +1    1.5419930 +1    5.3509316 +1                      0.0000
  H        -5.36428350 +1    1.5902449 +1    5.5263872 +1                      0.0000
  H        -3.98271981 +1    1.5362752 +1    6.2276478 +1                      0.0000
  O         0.18965728 +1   -3.7409786 +1    2.6612479 +1                      0.0000
  H        -0.25122521 +1   -3.7590093 +1    3.5291098 +1                      0.0000
  H         1.14338769 +1   -3.7667040 +1    2.8515652 +1                      0.0000
 Tv        -0.01590681 +1   -0.0350909 +1   10.7929422 +1 
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